Caracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites.

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dc.contributorJônatas Chagas de Oliveira, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Recursos Genéticos da Rede Bionorte, Universidade Federal do Acre; André Lucas Domingos da Silva, Programa de Pós-Graduação em Ciência, Inovação e Tecnologia para a Amazônia, Universidade Federal do Acre; Carla Cristina da Silva, Universidade Estadual de Campinas; Anete Pereira de Souza, Universidade Estadual de Campinas; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC.
dc.creatorOLIVEIRA, J. C. de
dc.creatorSILVA, A. L. D. da
dc.creatorSILVA, C. C. da
dc.creatorSOUZA, A. P. de
dc.creatorFORMIGHIERI, E. F.
dc.creatorCAMPOS, T. de
dc.date2020-10-10T09:17:19Z
dc.date2020-10-10T09:17:19Z
dc.date2020-10-09
dc.date2020
dc.date.accessioned2026-06-30T22:52:12Z
dc.descriptionO uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi extraído e utilizado para montagem das bibliotecas, as quais foram sequenciadas e tiveram seu genoma funcional montado com o software Trinity® e metodologia de novo. Um total de 336 milhões de reads foi obtido, dos quais 84.229 foram utilizados na identificação de microssatélites. Dos 4.461 marcadores encontrados, 186 foram selecionados para validação e 80 (43%) apresentaram perfil ideal de amplificação. Desses 80, 29 foram genotipados e apresentaram-se polimórficos. Foi possível acessar a diversidade genética em 20 genótipos. Esses dados indicam a informatividade dos novos marcadores, os quais poderão contribuir para acelerar o melhoramento do amendoim forrageiro.
dc.descriptionEditores técnicos: Virgínia de Souza Álvares; Fabiano Marçal Estanislau.
dc.formatBanner.
dc.formatp. 83-88.
dc.identifierIn: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2., 2019, Rio Branco, AC. A Contribuição da ciência para a agropecuária no Acre: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2020.
dc.identifierhttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125415
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/123456789/369907
dc.languagepor
dc.relation(Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 2).
dc.rightsopenAccess
dc.subjectForage peanut
dc.subjectRNA sequencing
dc.subjectRNA-Seq
dc.subjectCacahuetes forrajeros
dc.subjectAmendoim forrageiro
dc.subjectBelmonte
dc.subjectAmarillo MG-100
dc.subjectGenoma funcional
dc.subjectCultivo mixto
dc.subjectPastos forrajeros
dc.subjectLeguminosas forrajeras
dc.subjectRepeticiones de microsatélite
dc.subjectAnálisis de secuencia
dc.subjectEmbrapa Acre
dc.subjectRio Branco (AC)
dc.subjectAcre
dc.subjectAmazônia Ocidental
dc.subjectWestern Amazon
dc.subjectAmazonia Occidental
dc.subjectPastagem Consorciada
dc.subjectBanco de Germoplasma
dc.subjectMarcador Genético
dc.subjectGramínea Forrageira
dc.subjectLeguminosa Forrageira
dc.subjectMixed cropping
dc.subjectGermplasm conservation
dc.subjectSequence analysis
dc.subjectMicrosatellite repeats
dc.subjectArachis pintoi
dc.subjectForage legumes
dc.subjectForage grasses
dc.titleCaracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites.
dc.typeArtigo em anais e proceedings

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