Validação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica.

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dc.contributorPAULA DE SOUSA GUIMARÃES, Bolsista do Consórcio Pesquisa Café; JULIANA CAMARGO MARTINATI SCHENK, IAC, Bolsista INCT/CNPq; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LILIAN PADILHA, CNPCa; MARIA BERNADETE SILVAROLLA, IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa.
dc.creatorGUIMARÃES, P. de S.
dc.creatorSCHENK, J. C. M.
dc.creatorGIACHETTO, P. F.
dc.creatorPADILHA, L.
dc.creatorSILVAROLLA, M. B.
dc.creatorMALUF, M. P.
dc.date2019-11-12T18:06:12Z
dc.date2019-11-12T18:06:12Z
dc.date2019-11-12
dc.date2019
dc.date2019-11-14T11:11:11Z
dc.date.accessioned2026-07-07T04:15:57Z
dc.descriptionRESUMO: A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN.
dc.descriptionTítulo em inglês: Validation of active retrotransposons in coffee-effects of abiotic stress and low caffeine content on gene expression.
dc.format4 p.
dc.identifierIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.
dc.identifierhttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1114189
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/123456789/455940
dc.languagepor
dc.rightsopenAccess
dc.subjectSeleção-assistida
dc.subjectMelhoramento molecular
dc.subjectSequenciamento de RNA
dc.subjectExpressão gênica
dc.subjectPlantas sem cafeína
dc.subjectAssisted-selection
dc.subjectSequenciamento de transcriptoma
dc.subjectRNAseq
dc.subjectMolecular breeding
dc.subjectGene expression
dc.titleValidação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica.
dc.typeArtigo em anais e proceedings

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