Sequenciamento dos transcritos de Piper nigrum L. infectada com Fusarium solani f.sp.piperis utilizando Plataforma de nova geração.
| dc.contributor | EDITH CIBELLE DE OLIVEIRA MOREIRA, UFPA; SHEILA MAYSA DA CUNHA GORDO, UFPA; SYLVAIN DARNET, UFPA; SIMONE DE MIRANDA RODRIGUES, CPATU; IRACILDA DA CUNHA SAMPAIO, UFPA. | |
| dc.creator | MOREIRA, E. C. O. | |
| dc.creator | GORDO, S. M. da C. | |
| dc.creator | DARNET, S. | |
| dc.creator | RODRIGUES, S. M. | |
| dc.creator | SAMPAIO, I. da C. | |
| dc.date | 2013-02-25T11:11:11Z | |
| dc.date | 2013-02-25T11:11:11Z | |
| dc.date | 2013-02-25 | |
| dc.date | 2012 | |
| dc.date | 2013-02-25T11:11:11Z | |
| dc.date.accessioned | 2026-06-30T23:35:13Z | |
| dc.description | Neste trabalho nós extraímos o RNA total e isolamos o mRNA de raízes de Piper nigrum L. infectada com o fungo Fusarium solani f.sp. piperis na fase mais severa da infecção, para construção de uma biblioteca de fragmentos utilizando o método RNA-Seq. A biblioteca gerada foi sequenciada utilizando a plataforma de nova geração ?SOLiDTM 3 Plus System? (Applied Biosystems, EUA) produzindo 67.452.415 leituras com 50 pb. As leituras obtidas foram pré-processadas com softwares de Bioinformática para obtenção de leituras de alta qualidade. Para avaliar os dados pré-processados estatisticamente, foi utilizado o software FASTQC. Os resultados obtidos foram leituras com alta qualidade que serão usadas no processo de montagem, a fim de obter uma lista de transcritos de Planta expressos em resposta a infecção pelo patógeno. | |
| dc.format | 1 CD-ROM. | |
| dc.identifier | In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. | |
| dc.identifier | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/951009 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/123456789/385351 | |
| dc.language | por | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.subject | Piper nigrum L | |
| dc.subject | Bioinformática | |
| dc.subject | Sequenciamento de nova geração | |
| dc.title | Sequenciamento dos transcritos de Piper nigrum L. infectada com Fusarium solani f.sp.piperis utilizando Plataforma de nova geração. | |
| dc.type | Artigo em anais e proceedings |