Caracterização funcional do transcriptoma de amendoim forrageiro.
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O uso do amendoim forrageiro em consórcios com gramíneas nas pastagens e como cobertura verde, consorciado com culturas comerciais, tem crescido nos últimos anos. A análise do genoma funcional permite a identificação de genes de interesse agronômico. Assim, o objetivo deste trabalho foi realizar a anotação funcional de genes do transcriptoma de folhas de Arachis pintoi. Dos 98.432 transcritos analisados, 69% apresentaram correspondências com o banco de dados de proteínas do National Center of Biotechnology Information. As classes função molecular (36%) e processo biológico (35,8%) representaram a maioria dos termos de Gene Ontology atribuídos, enquanto o componente celular (28,2%) apresentou menor número. A análise de expressão diferencial identificou 1.550 e 1.357 genes com maior nível de expressão nas cultivares Amarillo e Belomonte, respectivamente. A análise de enriquecimento dos genes mostrou que 55,63% pertencem à classe componente celular, seguida por função molecular (26,48%) e processo biológico (20,89%). Esses resultados são o primeiro relato de anotação funcional de A. pintoi que irá fornecer uma importante fonte de informação para avanços nos estudos de expressão, silenciamento e edição gênica nos programas de melhoramento de Arachis.
Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.
Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.
Palabras clave
Amendoim forrageiro, Forage peanut, Cacahuetes forrajeros, Anotação funcional, RNA-seq, Transcriptoma, Hojas, Amarillo, Belmonte, Genoma, Folha, Método de Análise, Arachis pintoi, Genome, Transcriptome, Leaves