Ferramentas computacionais na identificação de genes PDS (fitoeno desaturase) em bananeiras de forma a subsidiar estudo de caso com uso de CRISPR-cas9 para tolerância ao déficit hídrico.
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A seca é a principal ameaça agrícola no mundo, limitando a produção e causando impactos no crescimento, na fisiologia e reprodução das plantas. Desse modo, o uso de variedades de bananeira mais tolerantes ao déficit hídrico, é uma das maneiras eficazes de mitigar esses impactos negativos na produção da fruta. Para isso, a edição do genoma é uma ferramenta que permite a manipulação de material genético para induzir mutações em regiões pontuais de interesse ou introduzir novos genes para que o organismo apresente um fenótipo desejável. O programa de melhoramento de bananeira da Embrapa Mandioca e Fruticultura, nas últimas décadas, vem investindo em linhas de pesquisa que aportem ferramentas moleculares em suporte ao desenvolvimento de cultivares com maior tolerância ao déficit hídrico. Uma dessas ferramentas é o CRISPR-Cas9 (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Region), que já vem sendo usada em Musa spp. com sucesso. Esta técnica permite a edição de partes do genoma por meio de “cortes” e substituição ou adição de sequências ao DNA de um genótipo qualquer. No entanto, para início do estudo de caso do uso de CRISPR-Cas9 em bananeira, propõe-se fazer o knock-out do gene PDS (Fitoeno desaturase), que participa da rota da produção de carotenos nas plantas e cujo knock-out leva ao albinismo, fenótipo de fácil visualização. Desse modo, esse estudo inicial irá subsidiar estudo de caso com uso de CRISPR-cas9 para tolerância ao déficit hídrico. [...].
Palabras clave
Banana, Gene, Resistência a Seca, Genoma, Melhoramento Genético Vegetal, Genética Molecular, Biologia Molecular, Musa sp, Genótipo, Fenótipo, Caroteno, Biotecnologia, Gene expression regulation, Drought tolerance, Genome, Plant breeding, Molecular genetics, Molecular biology, Genotype, Phenotype, Genotype-phenotype correlation, Carotenes, Agricultural biotechnology