Desarrollo y aplicacion de PCR multiple para la deteccion simultanea de tres virus de ADN en camote (Ipomoea batatas L.)

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dc.creatorBerrocal, A.
dc.creatorRossel, G.
dc.creatorFuentes, S.
dc.creatorPérez, A.
dc.creatorCuéllar, Wilmer Jose
dc.creatorKreuze, Jan F.
dc.date2013
dc.date2015-03-11T12:04:52Z
dc.date2015-03-11T12:04:52Z
dc.date.accessioned2026-06-27T17:59:54Z
dc.descriptionEl virus colusivo del camote (SPCV, genero Cavemovirus), el virus del aclaramiento de venas del camote (SPVC, genero Solendovirus) y el virus del enrollamiento de hojas del camote (SPLCV, genero Begomovirus) son virus con genoma de ADN, presentes en el camote en infecciones virales simples o multliples. La identificacion y deteccion de estos virus es complicada, ya que con frecuencia son asintomaticos y estan en concentraciones bajas en las plantas de camote. Se desarrollo una PCR multiple (mPCR) con el objetivo de lograr la deteccion simultanea de SPVC, SPVCV y SPLCV (y Begomovirus relacionados); para ellos se seleccionaron cebadores especificos para SPCV y SPVCV, y se utilizaron cebadores degenerados para Begomovirus (desarrollados por Li et al. 2004). Para la optimizacion de parametros se usaron plantas de camote con infecciones simples y mixtas. Se optimizo la concentracion de cebadores (0,1-0, 3uM), MgCl2 (2,5-8,0mM), dNTPs (0.2-0.8 mM), Taq-polimerasa (2-4U), parametros en el termociclador (temperatura de hibridacion de 48-62 oC y el numero de ciclos de 29-35), y la cantidad de acidos nucleidos (50-300 ng). Para validar le mPCR se uso plantas de camote de una coleccion de germplasma in vitro que estaban infectados con los virus en estudio y fueron confirmados por clonacion y secuenciamiento de las amplificaciones obtenidas. Los pares de cebadores especificos seleccionados para cada virus pudieron amplificar fragmentos de ADN en tamanos esperados, a una concentracion final de 0.16 uM para cebadores de SPCV y SPVCV, y 0.2uM para SPLCV. Ademas la concentracion de ADN adecuada esta entre 50-100 ng, con 30 ciclos termicos y 53 oC de temperatura de hibridacion. Este ensayo demostro ser simple, sensible y confiable para el diagnostico de rutina de SPCV, SPVCV y SPLCV (y Begomovirus relacionados). El ensayo de mPCR sera util para programas de cuarentena, como un metodos rapido y rentable para un gran numero de muestras.
dc.formatapplication/pdf
dc.identifierhttps://hdl.handle.net/10568/57040
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/123456789/151939
dc.languagees
dc.rightsLimited Access
dc.sourceBerrocal, A.; Rossel, G.; Fuentes, S.; Perez, A.; Cuellar, W.; Kreuze, J. 2013. Desarrollo y aplicacion de PCR multiple para la deteccion simultanea de tres virus de ADN en camote (Ipomoea batatas L.) In: Asociacion Peruana de Fitopatologia (APF). Libro de Resumenes. 22. Congreso Peruano de Fitopatologia. 17 Congreso Latinoamericano de Fitopatologia (CPLAF - 2013). Lambayeque (Peru). 1-5 Oct 2013. Lima (Peru). APF. p. 73.
dc.subjectsweet potatoes
dc.subjectplant viruses
dc.subjectplant diseases
dc.subjectpcr
dc.subjectdna
dc.titleDesarrollo y aplicacion de PCR multiple para la deteccion simultanea de tres virus de ADN en camote (Ipomoea batatas L.)
dc.typeConference Paper

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