Análise de transferibilidade de marcadores SSR entre espécies da família Fabaceae.

GRIPPI, E.; FERREIRA, M. A.; GOUVEIA, E. G. de; MORETZSOHN, M. de C.; AMARAL, Z. P. de S.; BUSO, G. S. C.

Análise de transferibilidade de marcadores SSR entre espécies da família Fabaceae.

Autores

Descripción

A família Fabaceae compreende duas espécies, entre outras, de significativa presença no agronegócio brasileiro e de alto valor nutricional, o feijão (Phaseolus vulgaris) e os amendoins (Arachis hypogaea). Continuamente, estão sendo desenvolvidos pares de primers específicos para regiões hipervariáveis (microssatélites) dos genomas de feijão e amendoim, que estão sendo utilizados em análise genética, no desenvolvimento de mapas de ligação e na detecção de regiões genômicas que controlam resistência a doenças nestes gêneros. O desenvolvimento de marcadores microssatélites envolve grande dedicação, tempo, custo elevado e mão de obra especializada. A potencial conservação de regiões flanqueadoras destes locos hipervariáveis em gêneros da mesma família é muito importante para o rápido desenvolvimento de um arsenal tecnológico de marcadores moleculares altamente informativos para outras espécies de importância econômica, bem como para o conhecimento da conservação de regiões genômicas entre espécies e de suas relações sintênicas. O objetivo deste trabalho foi verificar a transferibilidade por meio da otimização das condições de amplificação de primers SSR desenvolvidos para feijão, em amendoim, e vice-versa, que por serem da mesma família, provavelmente possuem homologia das regiões que flanqueiam os microssatélites. Duzentos primers SSR foram testados, 100 desenvolvidos para feijão e 100 para amendoim. Uma pesquisa BLAST ((Basic Local Alignment Search Tool ) foi realizada para comparar as seqüências dos clones que originaram os primers às seqüências depositadas no banco público de seqüências NCBI (National Center for Biotechnology Information ) para identificação de nível significativo de similaridade a uma sequência gênica identificada. Obteve-se 40% de transferibilidade de feijão para amendoim e 60% de amendoim para feijão. Algumas seqüências de clones tiveram similaridade significativa a genes constitutivos e funcionais.