Classes de genes de resistência expressos por Urochloa decumbens cv. Basilisk e outras seis espécies de Poaceae.
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O Urochloa decumbens cv. Basilisk é uma forrageira utilizada devido a sua tolerância a solos com alto teor de alumínio e baixa fertilidade, além de rápido estabelecimento. As forrageiras são constantemente atacadas por outros organismos e possuem, assim, mecanismos pré-formados e induzíveis de autodefesa, que estão relacionados a genes de resistência (Genes R). Esses genes têm papel fundamental no reconhecimento de proteínas específicas expressadas por genes de avirulência (Avr) e podem ser distribuídas em classes que apresentam diferentes mecanismos moleculares, sendo as principais, CNLs, TNLs, RLPs e RLKs. Assim, o objetivo do trabalho foi descobrir os genes de resistência expressos por U. decumbens que sejam comuns aos genes de resistência de outras gramíneas. Foi realizado um estudo do transcritoma de U. decumbens através do sequenciamento Illumina. As sequências foram tratadas e anotadas, e então, organizadas em um banco de dados. Em seguida, retribuíram-se sequências de transcrito primário das gramíneas Setaria italica, Sorghum bicolor, Brachypodion distachyon, Zea mays, Panicum virgatum e Oryza sativa do banco de dados Phytozome, organizando-as em um banco de dados local através de SQL.
Palabras clave
Genes R, Datamining, Graminea, Urochloa decumbens