Obtenção de ESTs potencialmente relacionadas à resistência do cafeeiro à ferrugem por meio de análise in silico.
| dc.contributor | FLÁVIA THIEBAUT ANDRADE, UFV/BIOAGRO; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; BÁRBARA HUFNAGEL MACIEL, UFV/BIOAGRO; SAMUEL MAZZINGHY ALVARENGA, UFV/BIOAGRO; EUNIZE MACIEL ZAMBOLIM, UFV; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, UFV. | |
| dc.creator | ANDRADE, F. T. | |
| dc.creator | CAIXETA, E. T. | |
| dc.creator | MACIEL, B. H. | |
| dc.creator | ALVARENGA, S. M. | |
| dc.creator | ZAMBOLIM, E. M. | |
| dc.creator | SAKIYAMA, N. S. | |
| dc.date | 2011-11-18T11:11:11Z | |
| dc.date | 2011-11-18T11:11:11Z | |
| dc.date | 2011-11-18T11:11:11Z | |
| dc.date | 2011-11-18T11:11:11Z | |
| dc.date | 2011-11-18 | |
| dc.date | 2007 | |
| dc.date | 2011-11-18T11:11:11Z | |
| dc.date.accessioned | 2026-07-01T00:25:22Z | |
| dc.description | A partir das informações geradas no Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) foram identificadas, por meio de análise in silico, seqüências potencialmente envolvidas na resistência a Hemileia vastatrix Berk. et Br. presentes nos cafeeiros. Foram usadas diferentes estratégias para minerar as seqüências de interesse. Inicialmente, palavras-chave que correspondem a termos relacionados aos mecanismos de resistência de plantas a patógenos foram obtidas da literatura e utilizadas como ?iscas? para mineração dos dados. Com o auxílio de ferramentas disponíveis na plataforma de bioinformática do PBGC, criaram-se projetos englobando as ESTs (Expressed Sequence Tags) relacionadas a cada uma destas palavras. Outra estratégia utilizada foi a busca por similaridades entre algumas seqüências envolvidas com a resistência do cafeeiro a doenças já publicadas com as seqüências do PBGC, por meio do algoritmo BLAST. Utilizou-se, também, o ?Electronic Northern?, uma ferramenta desenvolvida pelo Laboratório de Genômica e Expressão (LGE). A mineração, usando as três estratégias, identificou 8.968 seqüências do PBGC. O envolvimento ou ligação destas seqüências com genes de resistência à ferrugem do cafeeiro será confirmado, em trabalhos futuros, utilizando marcadores moleculares e técnicas de genômica funcional. | |
| dc.identifier | In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. | |
| dc.identifier | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/906362 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/123456789/403621 | |
| dc.language | por | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.subject | Mineração de dados | |
| dc.subject | Bioinformática | |
| dc.subject | Genômica | |
| dc.subject | Café | |
| dc.title | Obtenção de ESTs potencialmente relacionadas à resistência do cafeeiro à ferrugem por meio de análise in silico. | |
| dc.type | Artigo em anais e proceedings |