Análise in sílico da homologia do gene Serk em Gossypium hirsutum L. e espécies correlatas.
| dc.contributor | TAIZA DA CUNHA SOARES, RENORBIO/UFRPE; LIZIANE MARIA DE LIMA, CNPA; CARLIANE REBCA COELHO DA SILVA, ENORBIO/UFRPE; IGOR LUIZ VIEIRA DE LIMA SANTOS, UFCG; JULITA MARIA FROTA CHAGAS CARVALHO, CNPA; PÉRICLES DE ALBUQUERQUE MELO FILHO, UFRPE; ROSEANE CAVALCANTI DOS SANTOS, CNPA. | |
| dc.creator | SOARES, T. da C. | |
| dc.creator | LIMA, L. M. de | |
| dc.creator | SILVA, C. R. C. da | |
| dc.creator | SANTOS, I. L. V. de L. | |
| dc.creator | CARVALHO, J. M. F. C. | |
| dc.creator | MELO FILHO, P. de A. | |
| dc.creator | SANTOS, R. C. dos | |
| dc.date | 2017-02-20T11:11:11Z | |
| dc.date | 2017-02-20T11:11:11Z | |
| dc.date | 2017-02-20 | |
| dc.date | 2016 | |
| dc.date | 2017-02-20T11:11:11Z | |
| dc.date.accessioned | 2026-06-30T23:15:39Z | |
| dc.description | Nesse trabalho procedeu-se a uma análise in silico buscando homologia do SERK entre acessos de G. hirsutumL. e outras espécies relacionadas, com sequências depositadas em banco de genes (www.ncbi.nlm.nih.gov). As espécies selecionadas foram: G. hirsutum, Theobroma cacao, Citrus sinensis, Vitis vinifera, Glycine max e Phaseolus vulgaris. Sequências completas do gene (mRNA) foram alinhadas por meio do programa ClustalX (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2) para estimativa da similaridade gênica. A seguir, procedeu-se análise da proteína codificante pela ferramenta Blastx, do NCBI. Verificou-se que o gene SERK1 possui poucas regiões conservadas entre as espécies, contudo, foi observada homologia entre as sequências de G. hirsutum e Theobroma cacao com maior identidade na ordem de 86% e bit-score 681. Essa mesma relação (93%) foi observada entre as sequências de Phaseolus vulgaris e Glycine max com bit-score no valor de 1036, o que é esperado por se tratar de duas leguminosas, hermafroditas e cleistogâmicas. A espécie mais distante evolutivamente entre as demais foi aVitis vinífera. Baseando-se na análise dos aminoácidos, verificou-se alto grau de conservação dos principais domínios catalíticos. A proteína SERK possui domínio catalítico da serina/ treonina-kinase e pertence a uma subfamília envolvida em várias vias de sinalização, entre elas a restrição de proliferação de células em início de diferenciação. | |
| dc.identifier | In: ENCONTRO DE GENÉTICA DO NORDESTE, 21., 2016, Recife. Anais... Ribeirão Preto: SBG; Recife: UFPE: UFRPE: UPE, 2016. p. 55. | |
| dc.identifier | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1064789 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/123456789/377622 | |
| dc.language | por | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.subject | Embriogênese | |
| dc.subject | Citrus Sinensis | |
| dc.subject | Theobroma Cacao | |
| dc.title | Análise in sílico da homologia do gene Serk em Gossypium hirsutum L. e espécies correlatas. | |
| dc.type | Resumo em anais e proceedings |
