Identificação de ESTs tecido-específicas no banco de dados do genoma funcional de Coffea spp.

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dc.contributorDAIENE BITTENCOURT MENDES SANTOS
dc.contributorFELIPE RODRIGUES DA SILVA, CENARGEN
dc.contributorJULIANA DANTAS DE ALMEIDA, CENARGEN
dc.contributorLEILA MARIA GOMES BARROS, CENARGEN
dc.contributorMAURO CARNEIRO, CENARGEN.
dc.creatorSANTOS, D. B. M.
dc.creatorSILVA, F. R. da
dc.creatorALMEIDA, J. D. de
dc.creatorBARROS, L. M. G.
dc.creatorSOBRAL, L. T.
dc.creatorCARNEIRO, M.
dc.date2011-04-09T13:23:58Z
dc.date2011-04-09T13:23:58Z
dc.date2007-11-19
dc.date2006
dc.date2011-04-10T11:11:11Z
dc.date.accessioned2026-07-07T11:46:40Z
dc.descriptionO Brasil é o maior produtor e exportador mundial de café, respondendo por cerca de um quarto da produção mundial. Visando fornecer informações sobre o genoma do cafeeiro aos pesquisadores que buscam desenvolver variedades melhoradas, buscando manter produtividade e qualidade, foi elaborado e executado o projeto Brasileiro Genoma Café. Nesse projeto foram seqüenciadas 214.964 ESTs (Expressed Sequenced Tags) escolhidas aleatoriamente de 41 bibliotecas de cDNA de C. arabica, C. canephora e C. racemosa, representando diferentes tecidos em estágios específicos de desenvolvimento e tecidos submetidos a estresses biótico e abiótico. As ESTs foram agrupadas em 32.959 clusters (UniGenes), dos quais cerca de 22% têm função desconhecida. O objetivo deste trabalho foi identificar, no banco UniGene, ESTs abundantes e inéditas preferencialmente expressas em raiz, folha, flor ou fruto, que no futuro serão utilizadas na prospecção de seus respectivos promotores. Para tanto, foram realizados Testes Exatos de Fisher, contrastando bibliotecas de ESTs de um único tecido contra bibliotecas dos demais tecidos. Os resultados apontaram 103 UniGenes tecido-específicos, sendo 18 de folhas, 40 de frutos, 14 de raiz e 31 de botões florais. O Blast destas seqüências apontaram 84% de ESTs homólogos a seqüências conhecidas e 16% inéditas. De posse desses dados, a próxima etapa será validar os UniGenes selecionados mediante ensaios de Northen blot e RT-PCR.
dc.formatp. 84.
dc.identifierIn: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006
dc.identifierhttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188548
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/123456789/512387
dc.languagepor
dc.rightsopenAccess
dc.subjectBanco de dados
dc.subjectGenoma funcional
dc.subjectCoffea spp
dc.subjectBiologia Molecular
dc.titleIdentificação de ESTs tecido-específicas no banco de dados do genoma funcional de Coffea spp.
dc.typeResumo em anais e proceedings

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