Uso de raças fundadoras beneficiam a acurácia de genótipos imputados em bovinos da raça Canchim.
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Objetivou-se neste estudo avaliar melhorias na acurácia de imputação em animais Canchim e do grupo genético MA com a incorporação de genótipos de animais Nelore e Charolês. Foram testados oito cenários de imputação, em que os genótipos de alta densidade foram reduzidos para a densidade do painel BovineSNP50 BeadChip (50K) com capacidade de 54.609 SNPs apenas para a população alvo (CA e MA). A população de referência (Nelore e Charolês) permaneceu com genótipos em alta densidade. Foi determinada a acurácia de imputação por meio da taxa de concordância e quadrado de correlação alélica. Variações foram observadas quanto ao número de marcadores após o controle de qualidade dos genótipos em cada cenário. Os cenários C5 e C7 mostraram a maior acurácia pela contribuição do maior parentesco entre populações de animais CA e do grupo genético MA, e o C2 baixa acurácia de imputação devido ao tamanho inferior da população referência. Concluiu-se que a utilização de genótipos das raças fundadoras promove aumento na acurácia para os animais CA e MA, podendo reduzir os custos de genotipagem em raças compostas. A inclusão da raça Charolês como parte da população referência, em conjunto com animais CA, resulta nos maiores ganhos em acurácia.
Palabras clave
Bovinocultura de corte, Composição genética, Genômica, Bovinocultura, Marcador Molecular