Conservación y autentificación de cepas microbianas

dc.audienceTécnico
dc.audienceProfesional
dc.audienceProductor
dc.coverageSede Central
dc.coverageCentro de Investigación Palmira
dc.coverageCentro de Investigación Tibaitatá
dc.coverageColombia
dc.creatorBotero Rute, Lina Marcela
dc.creatorOvalle Másmela, Juan Camilo
dc.creatorCriollo Campos, Paola Jimena
dc.creatorPérez Moncada, Urley Adrián
dc.creatorUribe Gutiérrez, Liz Alejandra
dc.creatorGarcía Riaño, Jennifer Lorena
dc.creatorHerrera León, Rocío Fenney
dc.creatorTorres Higuera, Ligia Denise
dc.creatorLópez Ardila, David Emigdio
dc.creatorJiménez Velásquez, Sabrina del Carmen
dc.creatorBeltrán, Óscar Gabriel
dc.creatorEstrada Bonilla, Germán Andrés
dc.creatorBonilla Buitrago, Ruth Rebeca
dc.creatorAmaya Gómez, Carol Viviana
dc.creatorRengifo Ibáñez, María Camila
dc.creatorRodríguez Villamizar, Fernando
dc.creatorJiménez Sabogal, Hugo Rodolfo
dc.date2022-04-08T15:01:17Z
dc.date2022-04-08T15:01:17Z
dc.date2021
dc.date2021
dc.date.accessioned2026-06-27T04:53:31Z
dc.descriptionColombia es el tercer país del planeta en megadiversidad y sus colecciones biológicas son un patrimonio de gran importancia, no solo para la nación, sino para el mundo. La conservación de estos microorganismos y especímenes biológicos es vital para el país, en primer lugar, para proteger la diversidad biológica de los territorios y, en segundo lugar, porque estos son la base para el estudio y desarrollo de estrategias sostenibles y sustentables para la pro-ducción agrícola, pecuaria e industrial de la nación. Para el correcto mantenimiento y administración de las colecciones micro-bianas bajo la custodia de agrosavia, se ha requerido del estudio, la estanda-rización y el uso de diferentes técnicas de conservación que han permitido garantizar la viabilidad y pureza de los microorganismos en el tiempo, además de preservar sus características fisiológicas, bioquímicas y genéticas. En este capítulo se presentan las generalidades de los métodos de conservación mi-crobiana disponibles, incluyendo los crioprotectores más empleados para la conservación a corto, mediano y largo plazo.Adicionalmente, busca que los curadores o administradores de las colec-ciones biológicas conozcan un panorama general sobre la conservación y autentificación de cepas microbianas, con el fin de que dicha información permita mantener las características más relevantes y el potencial de los microorganismos conservados. También se mostrarán los procedimientos para realizar el control de calidad que ayuden a evidenciar la autenticidad microbiana mediante técnicas fenotípicas y moleculares. No obstante, en los siguientes capítulos se presentarán las particularidades de las colecciones que conforman el Banco de Germoplasma de Microorganismos de agrosavia, jun-to con las experiencias adquiridas en el transcurso de los años en cuanto a manejo, conservación y estudio de la identificación taxonómica y la caracte-rización de atributos de los microorganismos y especímenes biológicos con potencial biotecnológico.
dc.descriptionCorporación colombiana de investigación agropecuaria - AGROSAVIA
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/20.500.12324/37075
dc.identifierreponame:Biblioteca Digital Agropecuaria de Colombia
dc.identifierrepourl:https://repository.agrosavia.co
dc.identifierinstname:Corporación colombiana de investigación agropecuaria AGROSAVIA
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/123456789/39414
dc.languagespa
dc.publisherCorporación colombiana de investigación agropecuaria - AGROSAVIA
dc.relation40
dc.relation66
dc.relationAcinas, S. G., Marcelino, L. A., Klepac-Ceraj, V., & Polz, M. F. (2004). Divergence and redundancy of 16S rRNA sequences in genomes with multiple rrn operons. Journal of Bacteriology, 186(9), 2.629 -2.635. https://doi.org/10.1128/JB.186.9.2629-2635.2004
dc.relationAdzitey, F., Huda, N., & Ali, G. R. R. (2013). Molecular techniques for detecting and typing of bacteria, advantages and application to foodborne pathogens isolated from ducks. 3 Biotech, 3(2), 97-107. https://doi.org/10.1007/s13205-012-0074-4
dc.relationArencibia, D. F., Gámez, R., & Rosario, L. A. (2008). Métodos generales de conservación de microor-ganismos. En I Taller Científico de los Laboratorios Liorad, VI Taller de Colecciones de Cultivos Microbianos y Otros Materiales Biológicos (pp. 1-14).Liorad.
dc.relationBarragán Cárdenas, D. L., & Lesmes Hernández, A. del P. (2009). “Comparación de dos métodos de conservación, liofilización y microsecado sobre tres especies bacterianas”: elección del mejor método [tesis de grado, Pontificia Universidad Javeriana]. https://repository.javeriana.edu.co/bits-tream/handle/10554/8468/tesis432.pdf?sequence=1&isAllowed=y
dc.relationBhattacharya, S. (2018). Cryoprotectants and their usage in cryopreservation process. En Y. Bozkurt (ed.), Cryopreservation biotechnology in biomedical and biological sciences (pp. 7-19). IntechOpen.
dc.relationBochner, B. R. (2009). Global phenotypic characterization of bacteria. fems Microbiology Reviews, 33(1), 191-205. https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.2008.00149.x
dc.relationBurdsall, H. H., & Dorworth, E. B. (1994). Preserving cultures of wood-decaying Basidiomycotina using sterile distilled water in cryovials. Mycologia, 86(2), 275-280. https://www.fpl.fs.fed.us/documnts/pdf1994/burds94a.pdf
dc.relationCalderón Vargas, J. F. (2017). Ajuste de un modelo cinético para el crecimiento de Lactobacillus acidophilus en la fermentación de un sustrato complejo [tesis de pregrado, Fundación Universi-dad de América]. https://repository.uamerica.edu.co/bitstream/20.500.11839/6598/1/6121940-2017-2-IQ.pdf
dc.relationChatellard, L., Trably, E., & Carrère, H. (2016). The type of carbohydrates specifically selects microbial community structures and fermentation patterns. Bioresource Technology, 221, 541-549. https://doi.org/10.1016/j.biortech.2016.09.084
dc.relationEmerson, D., Agulto, L., Liu, H., & Liu, L. (2008). Identifying and characterizing bacteria in an era of genomics and proteomics. BioScience, 58(10), 925-936. https://doi.org/10.1641/b581006
dc.relationErttmann, S. F., & Gekara, N. O. (2019). Hydrogen peroxide release by bacteria suppresses inflammaso-me-dependent innate immunity. Nature Communications, 10(1), 1-13. https://doi.org/10.1038/s41467-019-11169-x
dc.relationFundora Hernández, H., Puig Peña, Y., Chiroles Rubalcaba, S., Rodríguez Bertheau, A. M., Gallardo Díaz, J., & Milián Samper, Y. (2013). Immunological methods for the quick identification of bacteria and protozoa in water. Revista Cubana de Higiene y Epidemiología, 51(1), 84-96. https://www.medigraphic.com/pdfs/revcubhigepi/chi-2013/chi131i.pdf
dc.relationGerhardt, P., Murray, R. G. E., Costilow, R. N., Nester, E. W., Wood, W. A., Krieg, N. R., & Phillips, G. B. (1981). Manual of methods for general bacteriology. asm Press.
dc.relationGülaydin, Ö., Ekín, I. H., Öztürk, C., İlhan, Z., & Ögün, E. (2019). Comparison of some bacterial identifica-tion methods. Turkish Journal of Veterinary Research, 3(1), 9-12. Retrieved from https://dergipark.org .tr/tr/pub/tjvr/is sue/4 4 815/506998
dc.relationHan, L., Pu, T., Wang, X., Liu, B., Wang, Y., Feng, J., & Zhang, X. (2018). Optimization of a protective medium for enhancing the viability of freeze-dried Bacillus amyloliquefaciens B1408 based on response surface methodology. Cryobiology, 81, 101-106. https://doi.org/10.1016/j.cryobiol.2018.02.003
dc.relationKerckhof, F.-M., Courtens, E. N. P., Geirnaert, A., Hoefman, S., Ho, A., Vilchez-Vargas, R., Pieper, D. H., Jauregui, R., Vlaeminck, S. E., Van de Wiele, T., Vandamme, P., Heylen, K., & Boon, N. (2014). Opti-mized cryopreservation of mixed microbial communities for conserved functionality and diversity. PLoS ONE, 9(6). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0099517
dc.relationKitamoto, Y., Suzuki, A., Shimada, S., & Yamanaka, K. (2002). A new method for the preservation of fungus stock cultures by deep-freezing. Mycoscience, 43(2), 143-149. https://doi.org/10.1007/S102670200021
dc.relationKrumnow, A. A., Sorokulova, I. B., Olsen, E., Globa, L., Barbaree, J. M., & Vodyanoy, V. J. (2009). Pre-servation of bacteria in natural polymers. Journal of Microbiological Methods, 78(2), 189-194. https://doi.org/10.1016/j.mimet.2009.05.017
dc.relationKupletskaya, M. B., & Netrusov, A. I. (2011). Viability of lyophilized microorganisms after 50-year stora-ge. Microbiology, 80(6), 850-853. https://doi.org/10.1134/S0026261711060129
dc.relationLiao, C.-H., & Shollenberger, L. M. (2003). Survivability and long-term preservation of bacteria in wa-ter and in phosphate-buffered saline. Letters in Applied Microbiology, 37(1), 45-50. https://doi.org/10.1046/j.1472-765X.2003.01345.x
dc.relationLiu, X., He, J., & Liao, C. (2016). Optimization of cryoprotectants to harvest high active cells of a Sce-nedesmus-lysing Enterobacter sp. during long-term preservation. Algal Research, 13, 298-302. https://doi.org/10.1016/j.algal.2015.12.014
dc.relationPeiren, J., Buyse, J., De Vos, P., Lang, E., Clermont, D., Hamon, S., Bégaud, E., Bizet, C., Pascual, J., Ruvira, M. A., Macián, M. C., & Arahal, D. R. (2015). Improving survival and storage stability of bacteria recalcitrant to freeze-drying: A coordinated study by European culture collections. Applied Mi-crobiology and Biotechnology, 99(8), 3.559-3.571. https://doi.org/10.1007/s00253-015-6476
dc.relationPhilip, N., Garba, B., & Neela, V. K. (2018). Long-term preservation of Leptospira spp.: Challenges and prospects. Applied Microbiology and Biotechnology, 102(13), 5.427-5.435. https://doi.org/10.1007/s00253-018-9047-9
dc.relationPolo, L., Mañes-Lázaro, R., Olmeda, I., Cruz-Pio, L. E., Medina, A., Ferrer, S., & Pardo, I. (2017). Influen-ce of freezing temperatures prior to freeze-drying on viability of yeasts and lactic acid bacteria isolated from wine. Journal of Applied Microbiology, 122(6), 1.603-1.614. https://doi.org/10.1111/jam.13465
dc.relationPrakash, O., Nimonkar, Y., & Shouche, Y. S. (2013). Practice and prospects of microbial preservation. fems Microbiology Letters, 339(1), 1-9. https://doi.org/10.1111/1574-6968.12034
dc.relationReiner, K. (2010). Catalase test protocol. American Society for Microbiology. https://www.asmscience.org/content/education/protocol/protocol.3226
dc.relationReller, L. B., Weinstein, M. P., & Petti, C. A. (2007). Detection and identification of microorganisms by gene amplification and sequencing. Clinical Infectious Diseases, 44(8), 1.108-1.114. https://doi.org/10.1086/512818
dc.relationShu, G., Hui, Y., Chen, S., Wan, H., & Chen, H. (2015). Application of plackett-burman design in scree-ning freeze drying cryoprotectants for Lactobacillus bulgaricus. The Annals of the University Dunarea de Jos of Galati. Fascicle vi: Food Technology, 39(1), 70-80. https://www.researchgate.net/publication/284746538_Application_of_plackett-burman_design_in_screening_freeze_dr-ying_cryoprotectants_for_Lactobacillus_bulgaricus
dc.relationShu, G., Zhang, B., Hui, Y., Chen, H., & Wan, H. (2017). Optimization of cryoprotectants for Strepto-coccus thermophilus during freeze-drying using Box-Behnken experimental design of response surface methodology. Emirates Journal of Food and Agriculture, 29(4), 256-263. https://doi.org/10.9755/ejfa.2016-07-960
dc.relationSinghal, N., Kumar, M., Kanaujia, P. K., & Virdi, J. S. (2015). maldi-tof mass spectrometry: An emerging technology for microbial identification and diagnosis. Frontiers in Microbiology, 6, 1-16. https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.00791
dc.relationSmith, A. C., & Marise, A. H. (2019). Gram stain protocols. American Society for Microbiology. https://asm.org/Protocols/Gram-Stain-Protocols
dc.relationSmith, D., & Ryan, M. (2012). Implementing best practices and validation of cryopreservation tech-niques for microorganisms. The Scientific World Journal, 2012, artículo 805659. https://doi.org/10.1100/2012/805659
dc.relationSmith, D., Ryan, M. J., & Stackebrandt, E. (2008). The ex situ conservation of microorganisms: Aiming at a certified quality management. En Encyclopedia of life support systems. Unesco-Eolss. ht-tps://www.researchgate.net/publication/266734069_The_ex_situ_conservation_of_microorga-nisms_aiming_at_a_certified_quality_management
dc.relationToju, H., Tanabe, A. S., Yamamoto, S., & Sato, H. (2012). High-coverage its primers for the dna-based identification of ascomycetes and basidiomycetes in environmental samples. PLoS ONE, 7(7), artículo e40863. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0040863
dc.relationTorres Higuera, L. D., Ortiz Ortega, D., Rodríguez Bautista, J. L., & Patiño Burbano, R. E. (2008). Com-paración de tres tratamientos para la crioconservación de serovares de Leptospira en nitró-geno líquido. Revista Corpoica − Ciencia y Tecnología Agropecuaria, 9(2), 72-76. https://doi.org/10.21930/rcta.vol9_num2_art:120
dc.relationTowey, J. J., Soper, A. K., & Dougan, L. (2012). Molecular insight into the hydrogen bonding and mi-cro-segregation of a cryoprotectant molecule. TheJournal of Physical Chemistry B, 116(47), 13.898-13.904. https://doi.org/10.1021/jp3093034
dc.relationWanger, A., Chavez, V., Huang, R. S. P., Wahed, A., Actor, J. K., & Dasgupta, A. (2017). Microbiology and mo-lecular diagnosis in pathology. Elsevier. https://www.sciencedirect.com/book/9780128053515/microbiology-and-molecular-diagnosis-in-pathology#book-info
dc.relationWolkers, W. F., & Oldenhof, H. (eds.). (2015). Cryopreservation and freeze-drying protocols (3.a ed.). Humana Press.
dc.relationWorld Federation for Culture Collections (wfcc). (2010). World Federation for Culture Collections guidelines. For the establishment and operation of collections of cultures of microorganisms. http://www.wfcc.info/guidelines/
dc.relationYamazaki, K., Okubo, T., Inoue, N., & Shinano, H. (1997). Randomly amplified polymorphic dna (rapd) for rapid identification of the spoilage bacterium Alicyclobacillus acidoterrestris. Bioscience, Biotech-nology, and Biochemistry, 61(6), 1.016-1.018. https://doi.org/10.1271/bbb.61.1016
dc.relationYang, B., Wang, Y., & Qian, P.-Y. (2016). Sensitivity and correlation of hypervariable regions in 16S rRNA genes in phylogenetic analysis. bmc Bioinformatics, 17(1), artículo 135. https://doi.org/10.1186/s12859-016-0992-y
dc.relationZhang, J., Liu, Q., Chen, W., Du, G., & Chen, J. (2016). Short communication: Protection of lyophilized milk starter Lactobacillus casei Zhang by glutathione. Journal of Dairy Science, 99(3). https://doi.org/10.3168/jds.2015-9540
dc.relationZhao, G., & Zhang, G. (2005). Effect of protective agents, freezing temperature, rehydration media on viability of malolactic bacteria subjected to freeze-drying. Journal of Applied Microbiology, 99(2), 333-338. https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2005.02587.
dc.relation[Conservación y manejo de la diversidad microbiana en los bancos de germoplasma para la alimentación y la agricultura en Colombia](http://hdl.handle.net/20.500.12324/36935)
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectGenética y mejoramiento animal - L10
dc.subjectRecursos genéticos
dc.subjectMicroorganismos
dc.subjectTransversal
dc.subjecthttp://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3218
dc.subjecthttp://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4807
dc.thumbnailhttps://repository.agrosavia.co/bitstreams/6a5778f5-b0a8-4402-8881-ff3c0c385d4c/download
dc.thumbnailhttps://repository.agrosavia.co/bitstreams/978a974d-2b5d-45a7-a45b-620e4ed66e14/download
dc.titleConservación y autentificación de cepas microbianas
dc.typeCapítulo

Archivos

Colecciones