Diferentes coeficientes de similaridade para análise de agrupamento de genótipos de Coffea canephora com base em marcadores moleculares.

dc.contributorMARIA AMELIA GAVA FERRAO, SAPC; AYMBIRE FRANCISCO A DA FONSECA, SAPC; ELAINE MANELLI RIVA-SOUZA, Bosista CBP&D/Café/INCAPER; ROMÁRIO GAVA FERRÃO, INCAPER.
dc.creatorFERRAO, M. A. G.
dc.creatorFONSECA, A. F. A. da
dc.creatorRIVA-SOUZA, E. M.
dc.creatorFERRÃO, R. G.
dc.date2011-11-18T11:11:11Z
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dc.date2011-11-18
dc.date2007
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dc.date.accessioned2026-07-01T00:25:21Z
dc.descriptionO objetivo deste trabalho foi comparar o agrupamento de 80 genótipos de C. canephora com 15 diferentes coeficientes de similaridade, obtidos por meio de marcadores moleculares RAPD. Os coeficientes de similaridade analisados foram: Jaccard, Nei e Li, Ochiai, Índice II, Coincidência simples, Rogers e Tanimoto, Sokal e Sneath, Yule, Índice I, Haman, Ochiai II, Índice III, Russel e Rao, Baroni et al. e Sokal. As estimativas de similaridade (Sgii?) entre todos os pares de genótipos (ii?) foram convertidas em dissimilaridade por meio do complemento aritmético dos coeficientes utilizados (Dgii? = 1 - Sgii?). Para a análise de agrupamento dos genótipos foi empregado o método de otimização de Tocher. Verificaram-se diferenças quanto ao número de grupos formados com a utilização dos diferentes coeficientes de similaridade, variando de quatro a 43. Houve concordância entre os coeficientes de Jaccard, Nei e Li, Ochiai, Índice II, Coincidência simples, Rogers e Tanimoto, Sokal e Sneath, Yule, Índice I, Haman, Ochiai II, Índice III e Baroni et al. quanto ao agrupamento dos genótipos mais dissimilares e mais similares. Os coeficientes de Russel e Rao e Sokal apresentaram dados discrepantes e sugere-se que não sejam utilizados. Os resultados em conjunto caracterizam a necessidade de estudos complementares para acurácia na definição do (s) coeficiente (s) para a análise de dados moleculares obtidos por meio de marcadores dominantes RAPD em C. canephora.
dc.identifierIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.
dc.identifierhttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/906284
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/123456789/403606
dc.languagepor
dc.rightsopenAccess
dc.subjectCoeficiente de similaridade
dc.subjectDivergência genética
dc.subjectMarcadores RAPD
dc.subjectCoffea
dc.titleDiferentes coeficientes de similaridade para análise de agrupamento de genótipos de Coffea canephora com base em marcadores moleculares.
dc.typeArtigo em anais e proceedings

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