Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial.

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dc.contributorSUZANA TIEMI IVAMOTO, UEL; OSVALDO REIS JUNIOR, UNICAMP; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC.
dc.creatorIVAMOTO, S. T.
dc.creatorREIS JUNIOR, O.
dc.creatorCARAZZOLLE, M. F.
dc.creatorDOMINGUES, D. S.
dc.creatorPEREIRA, L. F. P.
dc.date2014-01-08T11:11:11Z
dc.date2014-01-08T11:11:11Z
dc.date2014-01-08
dc.date2013
dc.date2014-01-08T11:11:11Z
dc.date.accessioned2026-07-01T00:26:03Z
dc.descriptionNeste trabalho foi realizado o seqüenciamento de RNA em larga escala de 12 bibliotecas de Coffea arabica cv. IAPAR59: folha, flor, frutos ao longo do seu desenvolvimento e frutos tratados com o indutor de metabolismo secundário metiljasmonato. Foram gerados no total 84.798.835 sequências (Illumina, HiSeq2000), que foram montadas em 127.600 contigs com tamanho médio de 1264bp, dos quais 65480 foram considerados como variantes de splicing únicos (unigenes). Neste trabalho, reportamos a montagem de novo do transcriptoma realizada com as sequências destas bibliotecas e os dados preliminares de anotação funcional e categorização. Trata-se do primeiro trabalho de sequenciamento Illumina com frutos de cafeeiro, que pode trazer importantes informações sobre genes candidatos relacionados a produção de compostos-chave envolvidos na qualidade do café e maturação de frutos.
dc.identifierIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.
dc.identifierhttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/975225
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/123456789/403904
dc.languagepor
dc.rightsopenAccess
dc.subjectRNA-Seq
dc.subjectTranscriptoma
dc.subjectIllumina
dc.subjectCoffea arabica
dc.titleTranscriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial.
dc.typeArtigo em anais e proceedings

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