Diversidade nucleotídica de genes envolvidos na biossíntese de ácidos clorogênicos de cafeeiros.
| dc.contributor | SUZANA TIEMI IVAMOTO, Universidade Estadual de Lodrina; DAVID POT, CIRAD; SERGIO DIAS LANNES, EPAGRI; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, IAPAR; LUIZ GONZAGA ESTEVES VIEIRA, IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC. | |
| dc.creator | IVAMOTO, S. T. | |
| dc.creator | POT, D. | |
| dc.creator | LANNES, S. D. | |
| dc.creator | DOMINGUES, D. S. | |
| dc.creator | VIEIRA, L. G. E. | |
| dc.creator | PEREIRA, L. F. P. | |
| dc.date | 2014-05-16T22:32:34Z | |
| dc.date | 2014-05-16T22:32:34Z | |
| dc.date | 2014-05-16 | |
| dc.date | 2013 | |
| dc.date | 2014-05-16T22:32:34Z | |
| dc.date.accessioned | 2026-07-01T00:26:06Z | |
| dc.description | Os ácidos clorogênicos (CGAs) são compostos químicos importantes de Coffea spp. para a qualidade da bebida, pois eles interferem na adstringência e podem alterar o aroma e sabor da bebida. Aproximadamente 310.000 ESTs de Coffea estão disponíveis e possibilitam o acesso à variabilidade nucleotídica da planta e o desenvolvimento de marcadores moleculares ligados à qualidade da bebida para as principais enzimas da via de biossíntese dos CGAs: PAL, C4H, 4CL, CQT e C3?H. Neste trabalho foram detectados polimorfismos dos tipos SNP, INDEL ou SSR dentro das sequências nucleotídidicas disponíveis no Projeto Genoma Café e no NCBI. As sequências de ESTs de CGAs foram clusterizadas pelo programa Codon Code Aligner, assim como a detecção de polimorfismos e validação dos mesmos (qualidade de cromatograma). Foram identificadas seis isoformas para PAL, uma para C4H, seis para 4CL, duas para CQT e duas para C3?H. Os contigs formados apresentaram um total de 248 polimorfismos (236 SNPs e 12 INDELs), sendo 201 na região codante (127 não sinônimos e 74 sinônimos). A frequência dos polimorfismos foi maior nas regiões UTRs (1pol/54pb), em relação à codante (1pol/81pb). A análise das sequências de C. arabica permitiu a identificação de 2 subgrupos diferentes de sequências, referentes aos seus genomas ancestrais (C. canephora e C. eugenioides). Foi observada a presença de 67,4% dos polimorfismos entre os grupos ancestrais e 32,6% dentro dos grupos em C. arabica. Esses resultados vêm permitindo definir genes tanto para estudos de expressão de homeólogos de CGAs como para o desenvolvimento de marcadores moleculares para o mapeamento genético. | |
| dc.identifier | Coffee Science, Lavras, v. 8, n. 2, p. 148-156, abr./jun. 2013. | |
| dc.identifier | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/986384 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/123456789/403934 | |
| dc.language | por | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.subject | SNPs | |
| dc.subject | SSRs | |
| dc.subject | ESTs | |
| dc.subject | CGAs | |
| dc.subject | Polimorfismo | |
| dc.subject | Marcador molecular | |
| dc.title | Diversidade nucleotídica de genes envolvidos na biossíntese de ácidos clorogênicos de cafeeiros. | |
| dc.type | Artigo de periódico |