Identificação e caracterização de microssatélites de Coffea arabica a partir de dados de sequenciamento de RNA e de BACS.
| dc.contributor | BRUNA SILVESTRE RODRIGUES DA SILVA, Bolsista Consórcio Pesquisa Café; SANDRA BELLODI CAÇÃO, UEL; SUZANA TIEMI IVAMOTO, UEL; JULIANA COSTA SILVA, Bolsista IAPAR; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC. | |
| dc.creator | SILVA, B. S. R. da | |
| dc.creator | CAÇÃO, S. B. | |
| dc.creator | IVAMOTO, S. T. | |
| dc.creator | SILVA, J. C. | |
| dc.creator | DOMINGUES, D. S. | |
| dc.creator | PEREIRA, L. F. P. | |
| dc.date | 2014-01-07T11:11:11Z | |
| dc.date | 2014-01-07T11:11:11Z | |
| dc.date | 2014-01-07 | |
| dc.date | 2013 | |
| dc.date | 2014-01-07T11:11:11Z | |
| dc.date.accessioned | 2026-07-01T00:26:01Z | |
| dc.description | O café é uma das principais commodities agrícolas mundiais, sendo consumido regularmente por 40% de toda população. As espécies, Coffea arabica L. e Coffea canephora P. são as de maior importância respondendo por 65% e 35% da produção mundial, respectivamente. Em C. arabica , o desenvolvimento de novas cultivares é demorado, podendo levar mais de 20 anos para finalização dos trabalhos. Além disso, estreita base genética de C. arabica dificulta a obtenção de cultivares resistentes a várias pragas e doenças, assim como uma maior tolerância a estresses abióticos. A utilização de marcadores moleculares para análise da diversidade e seleção de genótipos representa uma importante ferramenta para auxiliar o melhoramento e tentar diminuir esses problemas. Neste trabalho foi realizada identificação e análise in silico de SSR?s a partir de dados de RNA-seq de Iapar 59 e de sequências de BACs de Hibrido de Timor 832/2 (CaHT). Para Iapar 59 foram analisados 77 contigs, encontrados 39 SSR?s e desenhados 21 pares de oligonucleotídeos. Para CaHT foram analisados também 77 contigs, encontrados 35 SSR?s e desenhados 29 pares de oligonucleotídeos. Os motivos com maior frequência foram di, tri e tetranucleotídeos, sendo (AT) no motivo mais frequente entre os dois genótipos. Esta busca de sequências repetitivas é de grande importância para futura validação e aumento desses marcadores para estudos de diversidade genética, mapeamento, e a ssociação com características agronômicas de interesse. | |
| dc.identifier | In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013. | |
| dc.identifier | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/975072 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/123456789/403891 | |
| dc.language | por | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.subject | Marcador SSR | |
| dc.subject | Análise in silico | |
| dc.subject | RNA-seq | |
| dc.subject | Cromossomo artificial de bactéria | |
| dc.title | Identificação e caracterização de microssatélites de Coffea arabica a partir de dados de sequenciamento de RNA e de BACS. | |
| dc.type | Artigo em anais e proceedings |