Identificação de clusters gênicos biossintéticos relacionados a produção de antibióticos em pool bacteriano isolado de sedimentos de rios amazônicos.
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Descripción
O gênero Streptomyces (Classe: Actinobacteria) são bactérias gram-positivas, filamentosas, produtoras de esporos que apresentam crescimento ótimo em temperaturas entre 25 a 30 °C e pH de 6 até 9 (1). Espécies desse gênero apresentam ação biológica variada e são reconhecidas principalmente por seus produtos naturais altamente bioativos, sendo vários desses já comercializados (citação). Streptomyces spp. também são usadas para biocontrole de fitopatógenos de importância agrícola, tornando esses microrganismos de grande interesse biotecnológico voltado ao desenvolvimento de bioinsumos (2). Com os avanços tecnológicos nas áreas de sequenciamento de genomas, identificação de compostos e ferramentas de bioinformática como o AntiSMASH é possível identificar agrupamentos gênicos com potencial de produção de novas moléculas bioativas, esses, muitas vezes podem estar silenciados em condições de cultivo laboratoriais (citar). Nesse sentido, técnicas de biologia molecular como CRISPR-Cas9 e abordagem dependente de cultivo como OSMAC (One Strain Many Activity Compounds) têm aumentado a produção de compostos com pouco rendimento por meio do desbloqueio clusters gênicos biossintéticos (BGCs) (3, 4). Nesse sentido, o presente estudo visa avaliar o potencial biotecnológico de um pool bacteriano obtido de sedimentos do Rio Solimões por meio da mineração genômica voltada à identificação de BGCs.
Palabras clave
Bactéria, Doença de Planta, Streptomyces