Análise comparativa de famílias gênicas NRPS-PKS em Trichoderma: mecanismos evolutivos e diversificação biossintética de peptaibols.
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A mineração genômica é uma ferramenta essencial para investigar a diversidade de produtos naturais em fungos filamentosos. Avanços recentes em genômica têm impulsionado a descoberta de peptídeo sintetases não ribossomais (NRPSs); entretanto, a complexidade dos clusters de genes biossintéticos (BGCs) nesses organismos demanda abordagens computacionais integradas para análise sistemática. Neste trabalho, foi aplicado um pipeline que combina FungiSMASH para a predição e anotação de BGCs, além das plataformas BiG-SCAPE e CORASON, que permitem a construção de redes de similaridade, identificação de famílias gênicas e análise filogenética baseada em assinaturas enzimáticas. Investigamos 150 genomas de diferentes espécies de Trichoderma, destes, 60 genomas foram obtidos no NCBI, 80 no JGI e 10 oriundos do sequenciamento de linhagens da coleção da Embrapa Amazônia Ocidental, incluindo a linhagem CPAA-TM15, nova espécie Trichoderma isolada do rio Purus (Amazonas) filogeneticamente relacionada a Trichoderma subazureum e Trichoderma spirale.
ID do trabalho: 204/1213-0.
ID do trabalho: 204/1213-0.
Palabras clave
Microorganismo, Bioinformática, Trichoderma, Genética