Desenvolvimento de "inter-retrotransposon amplified polymorphism" para análise de diversidade genética em germoplasma de mandioca.
| dc.contributor | GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; MIGUEL COSTA DIAS, CPAA; NELCIMAR REIS SOUSA, CPAA. | |
| dc.creator | SILVA, A. M. O. DA | |
| dc.creator | SILVA, G. F. da | |
| dc.creator | DIAS, M. C. | |
| dc.creator | SOUZA, A. | |
| dc.creator | CLEMENT, C. R. | |
| dc.creator | SOUSA, N. R. | |
| dc.date | 2013-02-04T23:02:59Z | |
| dc.date | 2013-02-04T23:02:59Z | |
| dc.date | 2012-10-23 | |
| dc.date | 2012 | |
| dc.date | 2013-02-04T23:02:59Z | |
| dc.date.accessioned | 2026-06-30T23:18:39Z | |
| dc.description | A mandioca, Manihot esculenta Crantz, possui importância econômica na maioria dos países tropicais e subtropicais. A variabilidade genética da espécie não foi totalmente explorada e novas informações podem ajudar a expandir seu uso. Os marcadores moleculares baseados em retrotransposons, devido a sua abundancia no genoma, permitem uma eficiente análise de diversidade genética. O IRAP (Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism) é baseado no polimorfismo entre retrotransposons, possui uma alta reprodutibilidade, elevado nível de polimorfismo e baixo custo. O objetivo deste trabalho foi desenvolver primers para IRAP em mandioca. Oito diferentes retrotransposons do tipo LTR foram selecionados para o desenvolvimento de IRAP e os primers baseados nestes elementos foram denominados de ME_1 a ME_8. Foram analisados 21 indivíduos (12 de Anori/AM, 6 Anamã/AM e 3 da Bahia) provenientes do banco de germoplasma de mandioca da Embrapa Amazônia Ocidental. O percentual de loci polimórficos, heterozigosidade esperada (*h) e o Índice de Shannon (*I) foram calculados usando o software PopGene 1.31. Dos oito primers desenvolvidos, dois deles (ME_1 e ME_3) produziram poucas e fracas bandas. Os demais primers produziram de 21 a 61 bandas com médias de 85% de polimorfismo (65,5 - 97), 0,33 de heterozigosidade (0,24 ? 0,40) e 0,49 de índice de Shannon (0,35 ? 0,57). Dos pares de primers desenhados, ME_4 apresentou os menores valores e o ME_8 os maiores para todos os parâmetros avaliados. | |
| dc.identifier | In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012. Anais. Belém, PA. 2012. | |
| dc.identifier | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/937573 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/123456789/378649 | |
| dc.language | por | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.subject | IRAP | |
| dc.subject | Retrotransposon | |
| dc.subject | Manihot Esculenta | |
| dc.subject | Polimorfismo | |
| dc.title | Desenvolvimento de "inter-retrotransposon amplified polymorphism" para análise de diversidade genética em germoplasma de mandioca. | |
| dc.type | Artigo em anais e proceedings |